基于焦亡相关基因构建肾细胞癌预后风险模型
陈驰 1，何思萍 1，杨夏威 1，李海滨 2，吴基华 2，陆兵 1，李明虎 1，孙煦勇 1*
1.广西医科大学，广西 南宁，530021；2.广西医科大学第二附属医院，广西 南宁，530007
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摘要：
目的 基于焦亡相关基因构建肾细胞癌（RCC）预后风险模型。方法 从 TCGA 数据库下载 RCC 组及正常组 mRNA数据及临床数据，筛选焦亡相关差异基因，将单因素 Cox 回归分析和 Lasso 回归最终筛选出的焦亡相关基因用于预后风险模型的构建。根据风险评分中位数将患者分为高风险组、低风险组。通过基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）及单样本基因集富集分析（ssGSEA）进行差异表达基因功能分析与免疫分析。结果 共筛选出了 42 个焦亡相关差异基因，通过单因素 Cox 回归分析和 Lasso 回归最终筛选出 5 个焦亡相关基因用作预后风险模型的构建。GO与 KEGG 分析表明，差异表达基因主要与适应性免疫反应、病毒介导的细胞免疫和炎性细胞的趋化等有关；ssGSEA 表明，高风险组免疫细胞浸润水平、免疫相关途径活性总体高于低风险组。结论 基于 5 个焦亡相关基因构建的预后风险模型为 RCC 的诊断、治疗和靶点预测提供了新的方向。