铁死亡相关基因对肝细胞癌患者诊断及预后预测价值的研究
曹薇薇 1,王旭丹 2,岳树强 2,李霄 2*
1.安康职业技术学院,陕西 安康,725000;2.空军军医大学西京医院肝胆外科,陕西 西安,710032
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摘要:
目的 探讨铁死亡相关基因对肝细胞癌(HCC)患者诊断及预后预测的价值。方法 从 TCGA 数据库获取 HCC转录组数据和临床资料,采用 R 软件“Limma”包筛选差异表达基因,并与 FerrDb 数据库的铁死亡相关基因取交集,得到铁死亡相关差异表达基因。进一步采用 Kaplan-Meier 生存分析筛选预后相关铁死亡相关差异表达基因,GO 和KEGG 进行功能富集分析。采用 LASSO 回归分析和 Cox 回归分析筛选关键预后相关的铁死亡相关差异表达基因。ROC 曲线分析基因在 HCC 诊断及预后预测中的准确性。结果 差异表达分析和生存分析筛选出 ALB、CDKN2A、HRAS、JUN、MAPK3、NOX4 和 SRC 这 7 个预后相关的铁死亡相关差异表达基因。功能富集分析结果显示,这些基因主要为结合蛋白,富集在 ErbB 信号通路、GnRH 信号通路、VEGF 信号通路、AGE-RAGE 信号通路以及线粒体自噬等通路中。LASSO 回归分析和 Cox 回归分析结果显示,SRC 可作为 HCC 的独立预后因子(P<0.05)。ROC 曲线显示,SRC 在 HCC 诊断和预后预测上具有较高的准确性。结论 铁死亡抑制因子 SRC 在 HCC 患者的诊断及预后预测中具有较好的价值,是一个潜在的癌症治疗靶点。