宫颈癌组织基因表达谱差异筛选及功能预测
庞喜侠 1，刘晓霞 2*
1.上海市杨浦区控江医院妇科，上海，200093；2.复旦大学附属妇产科医院妇科，上海，200011
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摘要：
目的 筛选宫颈癌组织中的差异表达 mRNA，并探讨其生物学功能以及参与的信号通路。方法 通过对微阵列数据库 GSE63514 和 GSE55940 中的 33 例宫颈癌患者的宫颈癌组织和癌旁组织基因芯片数据进行生物信息学分析，筛选出差异表达 mRNA，并预测其参与的生物学功能和信号通路。结果 宫颈癌组织中，98 个 mRNA 上调，138 个 mRNA下调；其中 CTHRC1、ZIC2、MMP12、AIM2、CA9 的表达显著上调，CRNN、CRISP3、TMPRSS11B、SPINK7、MAL 的表达显著下调（P＜0.05）。基因本体论（GO）富集分析结果显示，表达上调的 mRNA 涉及 220 个生物学过程，表达下调的 mRNA 涉及 83 个生物学过程。京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析显示，上调 mRNA 显著富集到 Cell cycle、DNA replication、Toll-like receptor signaling pathway、Bladder cancer 和 IL-17 signaling pathway 5 条信号通路，下调 mRNA显著富集到 Arachidonic acid metabolism 和 Staphylococcus aureus infection 2 条信号通路。结论 本研究得到了宫颈癌组织中 mRNA 表达谱，其中异常表达的 mRNA（CTHRC1 和 CRNN）可能在宫颈癌的生理病理学中发挥关键作用。