基于生物信息学分析 VAMP8 在乳腺癌中的表达情况及调控机制
邱璞，黄胜超，李建文，张远起 *
广东医科大学附属医院乳腺外科，广东 湛江，524001
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摘要：
目的 基于生物信息学分析囊泡相关膜蛋白 8（VAMP8）在乳腺癌中的表达情况及调控机制，并分析 VAMP8 高表达与患者预后的关系。方法 用 Oncomine 数据库获取 VAMP8 在癌症组织及正常组织中的差异表达，用 HPA 数据库分析乳腺癌中 VAMP8 的阳性表达情况。用 cBioPortal 数据库获取 VAMP8 的共表达基因，随后用 String 数据库构建VAMP8 共表达基因的蛋白质互作网络，最后用 David 数据库分析其 GO 生物学功能及 KEGG 信号通路富集。结果 Oncomine 数据库显示，VAMP8 在癌症组织及正常组织中有 317 个数据集，在癌症组织中有 36 个高表达数据集、23 个低表达数据集，其中乳腺癌组织中有 12 个高表达数据集，中位等级为 191.5，P=4.89e-38。HPA 数据库显示，VAMP8 在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达，阳性蛋白主要集中在细胞质或细胞膜内。String 数据库显示，有 47 种蛋白质与VAMP8 有着直接或间接的联系。David 数据库显示了 VAMP8 共表达基因在乳腺癌中的具体调控机制。乳腺癌患者的无病生存期（DFS）缩短与 VAMP8 的高表达有关（P=0.0183）。结论 VAMP8 在乳腺癌组织中呈中、高度阳性表达，其可作为评估患者预后的分子标志物及基因治疗靶点。